神经外科为云南省医学重点学科，拥有成熟的医护队伍及国内外先进技术，可完成难度较大的各类手术。常规开展脑外伤、脑（脊髓）肿瘤、脑血管病（如：脑动脉瘤或血管畸形）的显微手术和介入手术，以及神经系统各类先天性疾病的手术治疗。

昆明医科大学附属延安医院口腔科是集医疗、教学、科研和预防于一体的综合性口腔专业科室。科室具有优良合理的团队组合，专业分化与国际接轨，形成了以口腔修复为主，配合有修复前准备和修复后牙周维护为核心的人才梯队。

延安医院呼吸与危重症医学科二病区是云南省首批“省级重点医学专科”，“昆明市重点医学专科”，“昆明市呼吸疾病质量控制中心”，“昆明市呼吸重症诊疗中心”及“昆明市睡眠呼吸疾病诊疗技术中心”，“昆明市咳嗽治疗中心”

昆明市延安医院普外科创立于建院伊始，是我院重点科室。现有医师18名，高级职称医师8人(教授、主任医师4人，副教授、副主任医师4人), 中级职称6人,初职4人，其中硕士研究生9人；博士2人，在读博士1人。

昆明医科大学附属延安医院心血管内科是国家卫健委批准的三个完备的国家级介入诊疗培训基地(冠心病，结构性心脏病，起搏与电生理)，云南省重点专科，云南省心脏疾病临床研究中心，云南省心血管疾病重点实验室

护理部是医院护理行政管理组织，负责全院护理行政管理、业务管理和教育管理。长期以来，护理部把“厚德、传承、博学、奉献”的院训落实在全院护理工作的每一个环节，在分管副院长的领导下，实行护理部主任-科护士长-护士长的三级护理管理模式、护士分层级管理。

昆明市延安医院康复医学科、设有门诊和住院病区，配有多种的康复治疗、训练设备，应用现代康复治疗技术结合中国传统疗法，开展多种疾病的康复包括：脑血管意外康复、颅脑损伤康复

昆明市延安医院麻醉科是全国骨科麻醉培训中心、国家老年麻醉联盟成员单位、云南省临床麻醉重点专科、昆明市临床麻醉应用研究中心、昆明医学会第七届麻醉学专科分会主任委员单位。昆明医科大学麻醉学专业学位硕士点。

延安医院呼吸与危重医学科一病区是省内较早开展呼吸内科专科诊治工作的科室。秉承优良的传统，经过了40多年的发展，目前科室硬件设施完善，人才梯队合理，拥有经验丰富的、训练有素的工作团队，已成为一个医疗技术、护理质量过硬的集临床医疗、教学、科研工作为一体的专业科室。

昆明医科大学附属延安医院泌尿外科成立于1980年。早在1983年就开展了同种异体肾移植手术，1987年常规开展肾移植手术，治疗肾功能衰竭200余人，在省内领先。2005年在西南地区率先开展“绿激光前列腺气化手术（PVP）”。2006被评选为“昆明市前列腺增生微创治疗中心”。

昆明市延安医院内分泌代谢病科始建于1986年，经过30余年的不断发展壮大，现已成为拥有雄厚的医疗技术力量，集医、教、研为一体的临床科室，并评为云南省重点科室、昆明市内分泌疾病诊疗质量控制中心、昆明市糖尿病诊疗技术中心、云南省糖尿病专科护士培训基地、国家药物临床研究机构。

普外二科成立于2009年11月，主要于血管疾病、甲状腺疾病及肛肠疾病治疗为主。为适应时代的发展、疾病的变化和人民对卫生健康的需求，昆明市延安医院于2011年普外二科与放射介入科合并，成立血管外科与微创介入治疗中心,普外科团队继续痔疮、肛周脓肿、肛瘘等肛周疾病和甲状腺疾病等传统优势外科疾病诊疗